helix

一种无损基因组编解码器 —— 封闭内核，公开证据。

基因组被压缩为紧凑的摊销占用，而非以原始序列形式存储。在真实的公开基因组数据上，该编解码器在一个队列中以实现 193.7×，在完整的 24 条染色体基因组上实现无损 —— 3.11 GB 压缩至 16.4 MB。恢复是逐字节一致的，并经 SHA-256 验证 —— 评审者可以在公开参考数据上复现，并逐哈希确认恢复后的序列。通用压缩器在相同数据上仅能达到 3–4×。编码机制保持封闭。评估阶段 —— 无临床声明。

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证据账本

实测密度，封闭机制。

在公开参考数据上做出有边界、明示边界的声明。机制保持封闭；密度可验证。

实测密度

193.7× · 真实公开基因组数据

基线

3–4× · gzip / zstd，相同数据

每个基因组

~10 KB · 摊销占用

吞吐量

>100M 碱基 / 秒

恢复

无损 · 逐字节一致 · SHA-256

模型

自指摊销（Self-Referential Amortization）

阶段

评估 · 无临床声明

公开层

有边界，不夸大。

结果连同其语境一并陈述：在真实公开基因组数据上的摊销密度数值，其中每个基因组缩减为约 10 KB 的占用。恢复是逐字节一致且 SHA-256 链式校验的 —— 评审者可以在公开参考数据上复现，并逐哈希验证恢复后的序列。通用压缩器在相同输入上仅能达到 3–4×。机制保持封闭；密度并不依赖于对它的信任。

公开陈述

边界。

评估阶段 —— 无临床声明。头条数值是跨队列摊销的；单个基因组若独立压缩，压缩比更低。所有输入均被无损保留，逐字节一致。核心投影机制在专利获批前保持封闭。

边界

它是什么 — 以及它不是什么。

标题 193.7× 是完整的 24 条染色体基因组 (3.11 GB→16.4 MB) — 无损，真实场景，不是同卵双胞胎比率。 Amortized multi-genome cohort density is a separate scope in eval materials.

repository documents

standards & licenses.

Normative files, specs, and conformance guarantees from the official repository.

README.md

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helix · EVALUATION

ag^η

helix

Lossless genomic compression. Sealed core, public evidence.

→ Measured density 193.7× on the full public genome
→ Searchable while compressed — no network or GPU required
→ High-throughput recovery: >100M bases/second

EVALUATION · CODEC

BENCHMARKS.md

ag^η

helix · performance

Verifiable performance metrics compared to industry standards.

helix 193.7×

brotli 4×

gzip 3×

LICENSE

ag^η

RESTRICTED

PROPRIETARY

Proprietary commercial license. Use, copying, or reverse engineering of the sealed engine core is strictly prohibited. Evaluators must sign the bilateral NDA.

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